首先修改httpd.conf,如果你只允许你的php脚本程序在web目录里操作，还可以修改httpd.conf文件限制php的操作路径。比如你的web目录是/usr/local/apache/htdocs，那么在httpd.conf里加上这么几行：　　

　　php_admin_value open_basedir /usr/local/apache/htdocs
　　

　　这样，如果脚本要读取/usr/local/apache/htdocs以外的文件将不会被允许，如果错误显示打开的话会提示这样的错误：

　　Warning: open_basedir restriction in effect. File is in wrong directory in

　　/usr/local/apache/htdocs/open.php on line 4

　　等等。

　　2.防止php木马执行webshell

　　打开safe_mode,

　　在,php.ini中设置

　　disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system　　

　　二者选一即可,也可都选　　

　　3.防止php木马读写文件目录　　

　　在php.ini中的

　　disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system　　

　　后面加上php处理文件的函数

　　主要有

　　fopen,mkdir,rmdir,chmod,unlink,dir

　　fopen,fread,fclose,fwrite,file_exists

　　closedir,is_dir,readdir.opendir

　　fileperms.copy,unlink,delfile

　　即成为

　　disable_functions= passthru,exec,shell_exec,system,fopen,mkdir,rmdir,chmod,unlink,dir

　　,fopen,fread,fclose,fwrite,file_exists

　　,closedir,is_dir,readdir.opendir

　　,fileperms.copy,unlink,delfile

　　ok,大功告成,php木马拿我们没辙了,^_^

　　遗憾的是这样的话,利用文本数据库的那些东西就都不能用了。　

　　如果是在windos平台下搭建的apache我们还需要注意一点,apache默认运行是system权限,这很恐怖,这让人感觉很不爽.那我们就给apache降降权限吧.　　

　　net user apache fuckmicrosoft /add　　

　　net localgroup users apache /del　　

　　ok.我们建立了一个不属于任何组的用户apche.　　

　　我们打开计算机管理器,选服务,点apache服务的属性,我们选择log on ,选择this account ,我们填入上面所建立的账户和密码,重启apache服务,ok,apache运行在低权限下了.